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单细胞世界杯买球入口|世界杯买球网站|2022卡塔尔世界杯揭示乳腺癌细胞的克隆演化


研究背景


        乳腺肿瘤曾做过很多测序研究,也发现了许多突变位点,但我们对肿瘤内基因组异质性的认识却很少。本研究发展了一套全基因组和外显子单细胞测序方法,使用G2/M细胞,能够覆盖约91%的基因组。并将这种方法应用在正常的和肿瘤样本包括雌激素受体阳性和三阴性导管癌单个细胞。


研究方法





研究结果



1 本研究实验流程。





2 细胞拷贝数变异聚类热图。a:50个ER乳腺癌肿瘤细胞;b:50个三阴性肿瘤细胞病人。





3 三阴性乳腺癌分布及蛋白影响预测。a:无义突变的分布;b:Polyphen和SIFT预测得分。






研究结论


       数据表明非整数倍染色体重排发生在肿瘤发生的早期,并且随着肿瘤的增大保持稳定。而,点突变则是逐渐积累的,随时肿瘤的扩张而分化。许多各异的突变呈现出低频率(<10%)发生。通过算法分析,我们发现三阴性肿瘤细胞的突变率增加(13.3X)而ER+肿瘤不是。这些发现对乳腺癌的诊断、治疗及耐药性演化研究有重要帮助。




参考文献



Clonal Evolution in Breast Cancer Revealed by Single Nucleus Genome Sequencing. [Nature, 2014]


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